Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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ZBED3Q96IU2 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
ZBED3Q96IU2 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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ZBED3Q96IU2 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
ZBED3Q96IU2 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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