Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
C9orf135Q5VTT2 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
C9orf135Q5VTT2 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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