Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CTXN3Q4LDR2 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms