Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Q1T7F1 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Q1T7F1 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms