Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms