Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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SCN9AQ15858 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SCN9AQ15858 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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