Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
NPTX1Q15818 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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