Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms