Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
R3HDM1Q15032 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
R3HDM1Q15032 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
R3HDM1Q15032 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
R3HDM1Q15032 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
R3HDM1Q15032 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.68
R3HDM1Q15032 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
R3HDM1Q15032 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms