Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
LAPTM4AQ15012 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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