Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.53□□□□□ -2
DDX39BQ13838 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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