Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
SPTAN1Q13813 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SPTAN1Q13813 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
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