Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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ITGA9Q13797 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ITGA9Q13797 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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