Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NEUROD1Q13562 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms