Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PMS2P3Q13401 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PMS2P3Q13401 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms