Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ATMQ13315 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
ATMQ13315 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATMQ13315 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC0.84□□□□□ -2.28
ATMQ13315 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
ATMQ13315 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ATMQ13315 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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