Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
GRIN2BQ13224 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
GRIN2BQ13224 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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