Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CSTF3Q12996 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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