Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
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NFIAQ12857 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NFIAQ12857 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NFIAQ12857 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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