Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RBBP4Q09028 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms