Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRMP28827 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
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PTPRMP28827 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTPRMP28827 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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