Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
PTPRGP23470 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPRGP23470 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms