Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRDP23468 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRDP23468 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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