Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
ERVV-1B6SEH8 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
ERVV-1B6SEH8 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms