Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms