Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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RTL8BQ17RB0 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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RTL8BQ17RB0 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RTL8BQ17RB0 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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