Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CDKN3Q16667 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CDKN3Q16667 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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