Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FXNQ16595 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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FXNQ16595 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FXNQ16595 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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