Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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VAMP3Q15836 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
VAMP3Q15836 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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