Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SIX1Q15475 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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SIX1Q15475 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SIX1Q15475 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SIX1Q15475 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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