Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
SEC23BQ15437 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SEC23BQ15437 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178 ms