Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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SYCP1Q15431 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYCP1Q15431 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
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