Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GPNMBQ14956 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.98
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GPNMBQ14956 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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