Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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COL9A2Q14055 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
COL9A2Q14055 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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