Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CNGB1Q14028 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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CNGB1Q14028 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CNGB1Q14028 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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CNGB1Q14028 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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CNGB1Q14028 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
CNGB1Q14028 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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