Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CDK13Q14004 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDK13Q14004 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDK13Q14004 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CDK13Q14004 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CDK13Q14004 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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