Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
DDX39BQ13838 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
DDX39BQ13838 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
DDX39BQ13838 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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DDX39BQ13838 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.54□□□□□ -2
DDX39BQ13838 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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