Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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ITGA9Q13797 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
ITGA9Q13797 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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