Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
ATMQ13315 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
ATMQ13315 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ATMQ13315 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.4 ms