Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
GRIK3Q13003 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms