Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXD4Q12950 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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FOXD4Q12950 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXD4Q12950 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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