Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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CNTN1Q12860 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CNTN1Q12860 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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