Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VPREB1P12018 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms