Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBXN8O00124 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
UBXN8O00124 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.59□□□□□ -2
UBXN8O00124 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
UBXN8O00124 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
UBXN8O00124 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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