Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
TRIM35Q9UPQ4 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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