Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMG1Q96Q15 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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