Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FAM3DQ96BQ1 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms