Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZBED9Q6R2W3 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZBED9Q6R2W3 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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