Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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RTN1Q16799 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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RTN1Q16799 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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RTN1Q16799 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
RTN1Q16799 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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