Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NRF1Q16656 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NRF1Q16656 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
NRF1Q16656 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms